民族医药学院成立于2011年5月，以民族医药学科群为优势，以民族医药教育和科学研究为重点的二级学院，是云南省民族医药高级人才的培养基地。有省级重点实验室和省高校重点实验室共2个，云南民族医药保护与产业发展研究基地等科研平台。云南省傣医药与彝医药重点实验是云南省唯一一个民族医药类重点实验室。拥有云南省目前唯一的省级传统医药博物馆——云南省中医药民族医药博物馆，1个临床研究和教学基地、13个民族民间医药传习基地。构建了我国目前唯一傣医学本科、硕士、博士人才培养体系。
学院现有民族医学（含学术型、专业型）、民族药学（学术型）硕士学位点，联合培养了全国第一个傣医学和彝医学博士。傣医学专业2021年傣医学专业列为云南省一流专业建设点。
2011年成立民族医药学院，院内下设4个办公室、2个科研实验平台、1个云南民族医药保护与产业发展研究基地等科研平台、1个省级重点学科、2个国家中医药管理局重点学科、1个临床研究和教学基地、13个民族民间医药传习基地。
民族医药学院现有在职在编教职工30人，专兼职教师及研究人员50名，具有博士学位31人。博士生导师3人，硕士生导师46人，第六批全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师1名，云南省名中医2名，全国老中医药专家学术继承指导教师3人，云南省中青年学术和技术带头人1人，云南省名中医2人。通过多年的建设现已建成一支多学科交叉、院内外结合，扎根边疆、经验丰富，医、药、文结合的多学科民族医药学术研究团队和师资队伍。
2013年申办傣医学本科专业获教育部批准设置，2014年起招收培养我国首批傣医学本科生。民族医药学院构建了本科、研究生全日制教育民族医学和民族药学人才培养形式，建立了民族医和民族药本科、硕士、博士人才培养体系。
2008年起至2023年培养民族医学和民族药学专业的硕士研究生88人，现有在读研究生49人。2012年与北京中医大学联合培养民族医学博士2名，2017年培养了我国第一位傣医学博士。
（一）“民族医学”学科
“民族医学”学科始建于20世纪80年代，2006年被批准为院级重点建设学科和云南省省级重点建设学科。2010年学科通过云南省教育厅验收，现为云南省重点学科。
自2006年至2012年学科建设以来，学科以民族医药研究发展中心为平台，申报建设了云南省高校“云南民族药现代研究重点实验室”，“云南民族医药保护与产业发展研究基地”、云南省中医药民族医药博物馆、国家中医药管理局重点建设学科“傣医学”与“傣药学”，初步构建了我院民族医药教学、科研的平台。
学科建立了现已拥有30余人民族医药研究团队；招收了我国首批中医专业傣医方向的本科生；培养了59名民族医学药硕士研究生；承担或完成民族医药科研项目28项，其中国家级及省部级课题26项。学科成员共发表民族医药方面学术论文206篇，出版民族医药教材、专著20部。其中编写出版了我国首套“二十一世纪傣医本科教育规划教材”，编撰出版了我国第一部白族医药专著《云南白族医药》和第一部纳西医药专著《纳西东巴医药研究》等民族医药专著。2009年“傣医药理论的整理研究”项目获云南省科技进步二等奖，实现了民族医学学科跨越式的发展。
（二）、“民族药学”学科
“民族药学”学科2017年申报，2018年获教育部批准备案招生，2019年首次招生，2022年首批4名研究生顺利毕业。民族药学是研究少数民族各种药物的基本理论、基源、化学成分、药理作用、安全性、临床应用及其管理等知识和实践的一门学科。它是民族医药学体系中的重要组成部分，有独特的理论体系和丰富的实践内容。
民族药学研究的目的是为了临床安全、有效、质量可控；研究的内容不仅包括与民族药有关的理论和应用知识，还涉及民族药物史、药名训释、传统用药品种、民族药材的基源、种植驯养、采收、贮存养护、加工炮制、制剂、化学成分、药理有效性及其作用机制、安全性及药事管理，以及有关的自然科学和哲学、文化、地理、天文等人文知识。
现有2个科研实验平台，即云南省傣医药与彝医药研究重点实验室和云南省高校民族药现代研究重点实验室；1个云南民族医药保护与产业发展研究基地等科研平台；建设有1个“民族医学”省级重点学科；2个国家中医药管理局重点学科，即“傣医学”、“傣药学”重点学科；1个云南中医药大学附属傣医医院及云南中医药大学附属彝医医院的临床研究和教学基地；13个民族民间医药传习基地。
近年来，承担或完成民族医药科研项目36项，其中国家级18项、省部级课题12项。2018年“云南民族医药传承模式创新及应用示范”获云南省科技进步一等奖。2009年“傣医基础理论的整理研究”获云南省科技进步二等奖。“傣医学高等教育人才培养体系建设的研究和实践”获云南省第七届高等教育教学成果一等奖，云南省高校优秀教材奖2部、全国中医药高等教育学会二等奖1项。2009年“傣医学”被国家中医药管理局立项为重点建设学科，并于2015年通过验收并被推荐优秀重点学科。
近年来发表民族医药学术论文244篇，在国家核心期刊发表相关科研项目内容论文68余篇，主编出版《21世纪傣医本科规划教材》、《云南民族药大辞典》，香格里拉民族医药研究系列专著等20部；获奖共13项，其中省部级奖项9项，厅级奖项4项。
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